Una nueva raza de seres existen entre los humanos, estos seres poseen habilidades superiores a la de las personas, ellos son conocidos como diclonious son seres que sufrieron un tipo de mutación dándoles mayor fuerza y poderes telequinéticos, sus armas son conocidas como vectores representados por unos brazos.

La gran parte de los diclonious son mujeres, hay pocos hombres ya que no requieren del diclonious macho para poder reproducirse ya que lo llevan a cabo infectando a personas mediante sus vectores. Los diclonious son muy parecidos a un ser humano mas tienen una diferencia principal que es unos cuernos en su cabeza.

En un laboratorio secreto ubicado en una isla de Japón, se llevan acabo pruebas de estos nuevos seres para poder conocer la capacidad que tienen o el peligro que puedan representar. Una diclonious que estaba retenida en ese lugar debido a un "error" es liberada de sus ataduras, para lo cual aprovecha para escapar.

Los guardias de este lugar intentan detenerla, pero todos ellos terminan siendo brutalmente asesinados por aquella diclonious, es imposible que ellos puedan deternerla ya que sus vectores la protegen de cualquier tipo de arma común, al mismo tiempo al intentar escapar, Kurama, un encargado de el lugar, decide llamar a un francotirador para no permitir que escape. El disparo no da en el blanco, si no en la cabeza, así que solo logra herirla y termina callendo al agua.

Kouta y Yuka, unos primos que acaban de volverse a encontrar después de mucho tiempo de estar separados, deciden visitar los viejos lugares de su infancia, dirigiéndose hacia la playa, donde se encuentran con una chica en la esquina de la playa a la cual le ayudan. Esa chica despierta pero lo único que puede decir es "Nyuu" así que Kouta y Yuka deciden llevarla a su casa para poderle curar su herida, ¿Pero esta chica no es la asesina diclonious que escapo de ese lugar? ¿Por qué se comporta de forma tan inocente? ¿Qué es lo que sucederá con Kouta, Nyuu y Yuka ahora?